Persekutuan Mahasiswa Kristiani Teknik (PMKT) memiliki beberapa komisi di dalamnya. Komisi-komisi dalam PMKT bertugas sebagai unit pelaksana struktur organisasi dalam pelaksanaan kepengurusan dan kegiatan di PMKT.
KSB: Koordinator Umum, Sekretaris, dan Bendahara
KU (Koordinator Umum), KI (Koordinator Internal), dan KE (Koordinator Eksternal) bertugas untuk mengarahkan dan mengontrol koordinasi komisi dan keseluruhan pengurus agar berjalan sesuai visi misi PMKT. Selain itu, sekretaris juga menjalankan surat-menyurat dengan pihak-pihak lain diluar PMKT dan mengarsipkan segala dokumen-persuratan, serta bendahara membuat laporan dan mengelola aliran dana kas PMKT.
KPKB: Komisi Persekutuan Kelompok Besar
Komisi Persekutuan Kelompok Besar bertugas untuk hal-hal teknis yang berkaitan dengan ibadah terutama ESTUF. Terdapat 2 sub-komisi yakni bidang manajerial yang fokusnya kepada penyiapan rundown, pelayan ibadah, dan konsep serta bidang musik yang bertanggungjawab mendampingi pelayan ibadah serta melakukan pelatihan dan pengembangan di bidang musik.
KOMKOM: Komisi Komunikasi
Komkom bertugas untuk menyebarluaskan kegiatan-kegiatan PMKT sekaligus narahubung dengan pihak-pihak lain. Terdapat 2 sub-komisi yakni bidang desain yang bertugas mengelola media sosial PMKT untuk mengumumkan kegiatan PMKT sekaligus membuat desain grafis yang diperlukan untuk segala kegiatan PMKT serta bidang humas yang mengelola publikasi, penyebaran surat undangan, dan narahubung dengan pihak-pihak lainnya.
KOMHAT: Komisi Pemerhati
Komhat bertugas untuk memperhatikan anggota PMKT dan memfasilitasi bimbingan khusus bagi mereka yang membutuhkan, misalnya kunjungan, konseling, dan penghiburan, serta kepada anggota yang berulang tahun, wisuda, dan pertama kali hadir persekutuan. Selain itu, Komhat juga bertugas untuk mengurus pendataan anggota PMKT dan presensi kegiatan, serta menyiapkan kegiatan fellowship.
KDM: Komisi Doa dan Materi
KDM bertugas untuk menghubungi, menyusun, dan mengevaluasi topik pembicaraan pada kegiatan persekeutuan agar sesuai dengan kebutuhan PMKT dan juga mengadakan persekutuan doa rutin.
KOMKTB: Komisi Kelompok Tumbuh Bersama
Komisi Kelompok Tumbuh Bersama bertugas untuk mengurus serba-serbi KTB. KomKTB mempersiapkan dan mengkoordinasikan Kelompok Tumbuh Bersama (KTB), mulai dari pengenalan, pembentukan, hingga pengontrolan KTB melalui pelatihan pemimpin KTB, maupun mengadakan pendukung pertumbuhan KTB.
KOMMIS: Komisi Misi
Kommis bertugas untuk menyusun dan melaksanakan kegiatan misi PMKT yang mencakup aspek penginjilan, sosial, dan keteknikan, seperti aksi tanggap bencana, berbagi kasih, dan juga talkshow seputar misi. Kommis juga memfasilitasi mahasiswa dalam meningkatkan kemampuan dan pengetahuan, baik dalam bidang akademik maupun sosial melalui pelatihan-pelatihan.
KOMSARNA: Komisi Sarana, Prasarana, dan Dana
Komsarna bertugas untuk mengelola (inventarisasi dan merawat) semua sarana dan prasarana yang mendukung pelayanan di PMKT sekaligus mengoordinasikan kegiatan pendanaan untuk mendukung segala kegiatan PMKT.
KPPA: Komisi Pendampingan dan Penghubung Alumni
KPPA bekerjasama dengan KPPM (Komisi Pendampingan Pelayanan Mahasiswa) YAKT bertugas untuk mendampingi setiap komisi yang ada sekaligus menjadi narahubung antara PMKT dengan YAKT. Selain itu, KPPA juga mengadakan kegiatan persekutuan pra-alumni (RTG) dan membantu YAKT dalam mendata alumni baru.